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海上保安学校では、海上保安庁の一般職員として必要な知識及び技能の修得と心身の錬成を行います。
卒業後の業務に応じ４課程３コースが設けられ、航空課程や海洋科学課程といった海上保安大学校にはない課程も設置されており、実践的な授業で各分野のエキスパートを育てます。教育期間は課程ごとに１〜２年です。
船舶運航ｼｽﾃﾑ課程、航空課程、情報システム課程では、法律、海難救助、海上犯罪捜査・鑑識などの授業のほか、逮捕術等の訓練を行います。
海洋科学課程では、海象、気象、天文等、水路業務に関する授業を行います。
また全課程で練習船みうらでの乗船実習を行い、巡視船艇等の運用技能や実務を身につけます。
教育期間中は、寮生活を通じ、将来の職場において必要とされる規律、責任感、協調性、積極性を養います。
全ての課程で所定の実務経験の後、海上保安大学校の特修科に進むことにより、将来幹部として活躍する道も開かれています。
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